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科学家用单细胞绘制植物细胞的昼夜节律图?

最近,南方科学技术大学生物科学学院生物学系教授Zhai Jixian团队发表了有关“自然通讯”的最新研究。他们使用单细胞核转录组顺序技术在单细胞水平上绘制昼夜节律基因表达,从而揭示了特有拟南芥细胞类型的昼夜节律基因表达的表达,以及对调节剂节奏小说的识别。 ?作为植物内源性时机的机制,生物时钟可以帮助植物检测外部环境中的周期性变化,以确保植物在适当的时间执行主要的生理功能。近年来的研究表明,植物的生物钟表明细胞类型在摩尔功能调节和调节的组成中的特异性,这种异质性使植物可以更精确地检测和对环境变化的反应,从而优化生长和SAFETY技术。但是,传统的研究方法,例如组织或荧光素酶报告基因的整个顺序,很难更好地分析单细胞水平表达节奏的差异。另外,细胞壁的存在增加了单细胞分离的技术难度。为了对单细胞水平的昼夜节律基因表达模式进行全面综述,研究小组使用单细胞核RNA Order(SNRNA-SEQ)在拟南芥幼苗中执行两组样本的样本序列:持续的光线:高分辨率“强烈的“强烈”“强烈”每24小时进行每24个小时的采样,并“长期”,“长期”的“长期”小时和每小时48小时和48个小时和48个小时和48小时。该小组借助确定超过200,000个核的转录组的10倍基因组学平台,对拟南芥的昼夜节律建立了单细胞转录,并审查了不同类型细胞中主要生物钟Gen表达的差异。结果表明mOST基因仅在特定细胞类型中显示出表达的节奏,并且上部和地下器官之间的差异很大。此外,将振荡Gen与不同细胞组的比较表明,振荡基因集的四种类型的叶叶花细胞(S0,S1,S2,S7)非常相似。与S2和S7相比,发现共享振荡GEN的配对相综述,S0和S1中大多数基因的表达延迟,这表明在叶叶叶群体中存在更精致的生物钟调节机制。进一步的分析发现,被昼夜节律调节剂施肥的基因在多种细胞类型中同时振荡,其中大多数被称为时钟。基于SNRNA-SEQ高时空分辨率数据,ABF1也已被确定为新的节奏调节剂,其过度爆炸将大大缩短昼夜节律节奏循环。以上结果w病情进一步改善了植物生物钟的基因调节网络,并为系统检查当地社会机制提供了新的分子进入点。据报道,该研究建立的拟南芥昼夜节律的单图与数据资源网站集成在一起,并将为昼夜节律领域的后续相关研究提供数据支持。相关论文信息:https://dii.org/10.1038/s41467-025-59424-8

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